水利部科技推广中心成立于1993年12月，其前身是水电部科学技术委员会条件处，是经中编办批准的水利部综合事业局所属具有法人地位的差额补贴事业单位。

2000年经水利部批准，隶属于水利部综合事业局。

受水利部国际合作与科技司委托，中心承办国家级和部级水利科技计划项目的管理工作；负责水利行业重大科技成果管理；组织科技推广与科技成果鉴定、登记及奖励工作；负责水利水电重大装备和技术的研制开发与引进工作；承办水利行业知识产权、科技保密、技术市场等管理工作；科技中介服务等。2004年经水利部国际合作与科技司批准（国科科[2004]14号），取得了从事水利科技项目招标投标与水利科技评估工作的资格。

中心现有员工25人，其中具有高级职称以上的人员17人，中级职称5人，初级职称3人。包含水文、水资源、环境科学、机械、生态等学科专业。中心内设综合处、项目一处、项目二处、推广与产业处。