井水、地下水处理主要是为了去除铁锰、氨氮、泥沙、水垢等有害物质，使经过处理后的水质达到国家饮用水标准。目前井水、地下水处理主要是除铁、锰，因为在我国，地下水中铁锰含量偏高相当普遍，除铁锰主要采用曝气加过滤，过滤用的过滤介质通常用石英沙、锰沙，后面再经过活性炭及精密过滤器进行过滤，经处理后，水质基本上能达到国家饮用水标准。而氨氮则大多采用超滤或反渗透过滤工艺，泥沙及水垢可采用多介质过滤及离子交换软化装置进行过滤。
      地下水中一般含水量盐量、硬度、碱度较高，胶体、悬浮物含量较少，色度、浊度较低，但此类水源中可会存在亚铁离子、锰离子、硅酸化合物等。所以对于此类水源的预处理可以采用曝气或氧化，目的在于将亚铁离子氧化为铁离子，然后混凝过滤。而对于H含量较多时，可通过加酸脱除CO2，如果硅的含量偏高，可通过添加分散剂、调节PH与温度等方法防止硅垢。